هيأت امنا عالي‌ترين ركن مؤسسه مي‌باشد كه وظايف و اختيارات آن در قانون تشكيل هيأت هاي امناي دانشگاه‌ها و مؤسسات آموزش عالي و پژوهشي (مصوب جلسات 181 و 183 مورخ 1367/12/09 و 1367/12/23 شوراي عالي انقلاب فرهنگي) و همچنين قانون نحوه انجام امور مالي و معاملاتي دانشگاه‌ها و مؤسسات آموزش عالي و تحقيقاتي (مصوب مورخ 1369/10/18 مجلس شوراي اسلامي) تعيين شده است.
هيأت هاي امنا در راس ساختار سازماني دانشگاه ها و مؤسسات آموزش عالي و پژوهشي به عنوان بالاترين مرجع تصميم گيري و سياست گذاري در امور مالي، معاملاتي، اداري، استخدامي و علمي، مسئوليت هاي مهم و حساسي به عهده دارند.
وظايف و اختيارات هيأت امناء
الف- تصويب آيين‌نامه داخلي؛
ب-تصويب سازمان اداري مؤسسه؛
ج-بررسي و تصويب بودجه مؤسسه؛
د-تصويب بودجه تفصيلي مؤسسه؛
ه-تصويب حسابها و ترازنامه سالانه مؤسسه؛
و- تصويب نحوه وصول درآمدهاي اختصاصي و مصرف آن؛
ز- تعيين حسابرس و خزانه‌دار براي مؤسسه؛
ح- جلب كمك هاي بخش خصوصي با رعايت ضوابط؛
ط- تصويب آيين‌نامه‌هاي مالي و معاملاتي؛
ی- پيشنهاد فوق‌العاده حقوق اعضاي هيأت علمي و غير هيأت علمي جهت تأئيد وزارت علوم؛
ک - تعيين نحوه اداره واحدهاي توليدي، خدماتي، كارگاهي و بهداشت و درماني مؤسسه؛
ل - تعيين ميزان پرداخت حق‌التحقيق، حق‌التدريس، حق‌الترجمه، حق‌التأليف و ....
ن - تصويب مقررات استخدامي اعضاي هيأت علمي مؤسسه كه به منظور هماهنگي پس از تأييد وزارتخانه مربوط قابل اجرا خواهد بود.